Un auto-entrepreneur peut utiliser gratuitement des logiciels comme Indy, Henrri ou Facture.net pour émettre devis et factures. À partir du 1er septembre 2026, il devra pouvoir recevoir ses factures via une Plateforme Agréée, puis émettre lui-même ses factures au format électronique dès le 1er septembre 2027. Le critère de choix déterminant n'est donc plus seulement le prix, mais la certification Plateforme Agréée du logiciel et sa gestion des nouvelles mentions obligatoires, comme le numéro
Chercher un logiciel de facturation pour auto-entrepreneur revient aujourd'hui à répondre à deux questions distinctes : combien cela coûte, et le logiciel sera-t-il encore valable après la réforme de la facturation électronique. La réception des factures électroniques devient obligatoire pour tous les auto-entrepreneurs dès le 1er septembre 2026, et l'émission de leurs propres factures électroniques le devient à son tour le 1er septembre 2027.
Cette échéance change la donne pour qui compare des outils gratuits. Un logiciel qui produit de belles factures PDF ne suffit plus si ce PDF, envoyé par e-mail, ne transite pas par une plateforme reconnue par l'administration.
Cet article détaille les solutions gratuites disponibles, le fonctionnement des Plateformes Agréées, les mentions obligatoires à faire figurer sur chaque facture, les sanctions encourues en cas d'erreur, et les prix réels pratiqués par les principaux éditeurs.
- La réception de factures électroniques devient obligatoire pour tous les auto-entrepreneurs le 1er septembre 2026, l'émission suit le 1er septembre 2027.
- Des solutions gratuites existent : Indy inclut un compte bancaire pro sans frais, Henrri propose plus de 40 modules gratuits sans publicité, Facture.net reste 100 % gratuit mais affiche des publicités.
- Une mention obligatoire manquante ou incorrecte sur une facture expose à une amende de 15 €, plafonnée à 25 % du montant de la facture.
- L'absence totale de facturation peut coûter jusqu'à 75 000 €, et jusqu'à 150 000 € en cas de récidive.
- Les activités exclusivement exonérées de TVA ne sont pas concernées par la réforme de la facturation électronique.
- Les tarifs des logiciels payants observés fin août 2026 vont de 9 € (Indy Plus, Abby) à environ 18 € par mois (Tiime START).
Un logiciel de facturation gratuit suffit-il pour démarrer ?
Plusieurs éditeurs proposent une version entièrement gratuite pensée pour les petits volumes de facturation. Indy associe un compte bancaire professionnel gratuit à une édition de devis et factures illimitée. Henrri revendique de son côté plus de 40 modules gratuits, sans publicité dans l'interface.
Facture.net reste totalement gratuit et sans limitation de nombre de factures, mais son interface affiche des publicités. Qonto propose lui aussi un module de facturation gratuit, réservant les relances automatiques et les factures récurrentes à ses offres payantes.
Gratuit ne signifie pas non plus sans limite de volume. Shine Facture réserve son offre sans frais à 5 clients et 5 factures par mois, ce qui la rend adaptée aux tout débuts d'activité mais rapidement insuffisante dès que le portefeuille clients grandit.
Qu'est-ce qu'une Plateforme Agréée et pourquoi ce statut compte en 2026 ?
Une Plateforme Agréée (PA) est une solution privée immatriculée par l'État pour assurer la gestion de la facturation électronique. À partir du 1er septembre 2026, tout auto-entrepreneur doit pouvoir recevoir ses factures via une telle plateforme ; l'obligation d'émission suit le 1er septembre 2027.
Les formats structurés acceptés sont Factur-X, UBL et CII. Qonto et Indy figurent déjà parmi les plateformes certifiées, tout comme Tiime. Henrri, en revanche, n'a pas ce statut : il s'agit d'une simple solution compatible.
Quelles mentions obligatoires doit contenir une facture d'auto-entrepreneur ?
L'obligation de facturer un client professionnel repose sur l'article L441-9 du Code de commerce. Au-delà des mentions classiques, la facture électronique impose désormais quatre informations supplémentaires.
Un auto-entrepreneur en franchise en base de TVA doit porter la mention "TVA non applicable, art. 293 B du CGI" jusqu'au 31 août 2026, puis une nouvelle formule référençant le Code des impositions des biens et des services à partir du 1er septembre 2026.
Pour un particulier, la facture devient obligatoire dès 25 €. Une fois émise, elle doit être conservée 10 ans.
- Numéro SIREN de l'acheteur.
- Adresse de livraison des biens, si elle diffère de l'adresse du client.
- Nature de l'opération facturée : livraison de biens, prestation de service, ou les deux.
- Option pour le paiement de la taxe d'après les débits, pour les entreprises concernées.
Que risque un auto-entrepreneur qui ne respecte pas ces obligations ?
Une mention manquante ou inexacte coûte 15 € par mention, dans la limite de 25 % du montant de la facture concernée.
L'absence totale de facturation est sanctionnée plus lourdement : jusqu'à 75 000 €, portée à 150 000 € en cas de récidive.
Pour la facturation électronique spécifiquement, chaque facture non émise sous format électronique coûte 50 €, avec un plafond de 15 000 € par année civile. Un manquement à l'e-reporting coûte 500 € par transmission, également plafonné à 15 000 € par an.
Côté clients professionnels en retard de paiement, une indemnité forfaitaire de 40 € est due, et le délai de paiement par défaut ne peut dépasser 45 jours.
Qui est réellement concerné par la facturation électronique obligatoire ?
Les professionnels qui réalisent exclusivement des opérations exonérées de TVA sont les seuls auto-entrepreneurs à ne pas être concernés par la réforme.
Les transactions avec des particuliers restent en dehors du champ de l'e-invoicing, quel que soit le régime de TVA de l'auto-entrepreneur.
En revanche, un auto-entrepreneur en franchise en base comme un auto-entrepreneur au régime réel sont tous deux soumis à l'obligation d'émission électronique pour leurs factures à des clients professionnels en France.
Combien coûte un logiciel de facturation pour auto-entrepreneur ?
Un logiciel de facturation électronique pour auto-entrepreneur coûte, selon les observations relevées fin août 2026, entre 0 et 10 € par mois pour la majorité des offres d'entrée de gamme.
Indy propose une formule Essentiel gratuite et une formule Plus à 9 €. Abby facture ses versions payantes à partir de 9 € également. Henrri, gratuit à l'inscription, propose une version payante à 17 €.
Tiime positionne sa version START à 17,99 €. Shine Facture reste gratuit dans sa formule limitée à 5 clients et 5 factures mensuelles, puis passe à 9 € pour lever ces plafonds.
Quelles fonctionnalités vérifier avant de choisir son logiciel ?
Les relances automatiques d'impayés ne sont pas systématiques dans les offres gratuites. Henrri et Tiime les incluent dans leur version sans frais, tandis qu'Indy et Facture.net ne les proposent pas du tout.
La synchronisation bancaire, qui évite de ressaisir chaque encaissement, est incluse gratuitement chez Abby et Qonto. Elle est absente chez Facture.net et Henrri.
Pour facturer depuis un chantier ou entre deux rendez-vous, l'application mobile fait la différence. Indy, Abby et Tiime en proposent une, contrairement à Henrri et Facture.net.
Notre avis
Le choix d'un logiciel de facturation pour auto-entrepreneur ne se limite plus au prix. Deux échéances encadrent désormais la décision : le 1er septembre 2026 pour la réception des factures électroniques via une Plateforme Agréée, et le 1er septembre 2027 pour leur émission. Les solutions gratuites comme Indy, Henrri ou Facture.net couvrent les besoins de base pour un faible volume de facturation, avec des compromis différents : publicité pour Facture.net, absence de relances automatiques pour Indy, absence d'application mobile pour Henrri. Dès que le volume de clients ou de factures augmente, les offres payantes observées fin août 2026, entre 9 € et environ 18 € par mois, ajoutent la synchronisation bancaire, les relances automatiques et l'application mobile. Le critère qui prime avant toute autre considération reste le statut de Plateforme Agréée ou de solution compatible du logiciel, faute de quoi son usage devra être révisé avant les échéances de 2026 et 2027.
Questions fréquentes
- Quel est le meilleur logiciel de facturation gratuit pour auto-entrepreneur ?
- Il n'existe pas un seul meilleur logiciel gratuit, mais des compromis différents selon vos priorités. Indy inclut un compte bancaire pro gratuit, Henrri offre plus de 40 modules gratuits sans publicité, et Facture.net reste 100 % gratuit et sans limitation mais affiche des publicités dans son interface.
- À partir de quand un auto-entrepreneur doit-il facturer électroniquement ?
- La réception de factures électroniques via une Plateforme Agréée devient obligatoire pour tous les auto-entrepreneurs le 1er septembre 2026. L'émission de leurs propres factures au format électronique devient obligatoire à son tour le 1er septembre 2027.
- Qu'est-ce qu'une Plateforme Agréée ?
- Une Plateforme Agréée (PA) est une solution privée immatriculée par l'État pour assurer la gestion de la facturation électronique des entreprises. Un logiciel qui n'a pas ce statut, comme Henrri à ce jour, reste utilisable mais devra passer par une plateforme tierce pour être conforme aux échéances de 2026 et 2027.
- Que risque un auto-entrepreneur qui oublie une mention obligatoire sur une facture ?
- Chaque mention manquante ou inexacte coûte 15 €, dans la limite de 25 % du montant de la facture. L'absence totale de facturation est bien plus lourde : jusqu'à 75 000 €, portée à 150 000 € en cas de récidive.
- Dois-je facturer mes clients particuliers ?
- Oui, dès que le montant atteint 25 €. Les transactions avec des particuliers restent toutefois exclues du champ de l'e-invoicing, contrairement aux factures adressées à des clients professionnels.
- Combien coûte un logiciel de facturation pour auto-entrepreneur ?
- Selon les tarifs observés fin août 2026, comptez entre 0 et 10 € par mois pour la plupart des offres d'entrée de gamme. Les formules payantes vont de 9 € (Indy Plus, Abby) à environ 18 € (Tiime START).
- Un auto-entrepreneur exonéré de TVA est-il concerné par la réforme de la facturation électronique ?
- Non. Les professionnels qui réalisent exclusivement des opérations exonérées de TVA sont les seuls auto-entrepreneurs à ne pas être concernés par la réforme de la facturation électronique.
- Combien de temps dois-je conserver mes factures d'auto-entrepreneur ?
- La durée de conservation obligatoire d'une facture est de 10 ans.